Longueur de protéine à partir de l'ARN
Calculateur
Résultats
- Résidus d'acides aminés
- 500
- Masse protéique estimée (Da)
- 55,000
- Masse protéique estimée (kDa)
- 55
- Codons traduits
- 500
Résultats de biologie et laboratoire
| Résidus d'acides aminés | 500 |
| Masse protéique estimée (Da) | 55,000 |
| Masse protéique estimée (kDa) | 55 |
| Codons traduits | 500 |
Diagramme formula-map
- Résidus d'acides aminés
- 500
- Masse protéique estimée (Da)
- 55,000
- Masse protéique estimée (kDa)
- 55
- Codons traduits
- 500
Décomposition de la formule
Formule
residues = nucleotides ÷ 3 ; MW ≈ residues × 110 Da= 500
Note
Modèle simplifié : ces résultats utilisent les relations de laboratoire classiques et des constantes moyennes (A260 = 1 pour 50 µg/mL d'ADN double brin, 617,96 g/mol par paire de bases, ~110 Da par acide aminé, croissance exponentielle idéale). Les échantillons réels varient selon la pureté, les contaminants, le tampon, la température et l'étalonnage de l'appareil. Vérifiez toujours avec vos propres étalons et votre protocole ; ne pas utiliser pour un usage diagnostique ou critique pour la sécurité.
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Voir tout →Questions fréquentes
Comment passe-t-on de la longueur de l'ARNm à la longueur de la protéine ?+
Chaque acide aminé est codé par un codon de trois nucléotides, donc le nombre d'acides aminés est égal à la longueur de la séquence codante en nucléotides divisée par trois, moins un pour le codon stop, qui n'est pas traduit en acide aminé.
Faut-il utiliser la longueur totale de l'ARNm ou uniquement la séquence codante ?+
Seule la longueur de la séquence codante (CDS) doit être utilisée, car l'ARNm inclut aussi des régions 5' et 3' non traduites qui sont transcrites mais non traduites ; utiliser la longueur totale de l'ARNm au lieu de la seule CDS surestimera la longueur de la protéine.
Pourquoi soustraire un codon à la fin ?+
Le dernier codon de la séquence codante est un codon stop (UAA, UAG ou UGA) qui signale au ribosome de terminer la traduction et ne correspond à aucun acide aminé dans la protéine finale, il doit donc être exclu du compte d'acides aminés.
La longueur de protéine obtenue inclut-elle la méthionine initiale ?+
Oui, le codon start AUG est traduit en la première méthionine de la chaîne polypeptidique, qui est incluse dans la longueur calculée ; cette méthionine initiale peut être retirée enzymatiquement après traduction dans la protéine mature, mais le calculateur indique la longueur du produit de traduction initial.
Pourquoi la protéine réelle pourrait-elle être plus courte que la longueur calculée ?+
Un traitement post-traductionnel comme le clivage d'un peptide signal, le retrait de la méthionine initiatrice, ou une maturation protéolytique peut raccourcir la protéine fonctionnelle finale par rapport à la longueur prédite directement à partir de la séquence codante.