Pourcentage de teneur en GC
Calculateur
Résultats
- Teneur en GC (%)
- 50
- Teneur en AT (%)
- 50
- Longueur de la séquence (nucléotides)
- 60
- Bases G + C
- 30
Résultats de biologie et laboratoire
| Teneur en GC (%) | 50 |
| Teneur en AT (%) | 50 |
| Longueur de la séquence (nucléotides) | 60 |
| Bases G + C | 30 |
Diagramme formula-map
- Teneur en GC (%)
- 50
- Teneur en AT (%)
- 50
- Longueur de la séquence (nucléotides)
- 60
- Bases G + C
- 30
Décomposition de la formule
Formule
GC % = (G + C) ÷ (A + T + G + C) × 100= 50
Note
Modèle simplifié : ces résultats utilisent les relations de laboratoire classiques et des constantes moyennes (A260 = 1 pour 50 µg/mL d'ADN double brin, 617,96 g/mol par paire de bases, ~110 Da par acide aminé, croissance exponentielle idéale). Les échantillons réels varient selon la pureté, les contaminants, le tampon, la température et l'étalonnage de l'appareil. Vérifiez toujours avec vos propres étalons et votre protocole ; ne pas utiliser pour un usage diagnostique ou critique pour la sécurité.
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Voir tout →Questions fréquentes
Comment calcule-t-on la teneur en GC ?+
La teneur en GC est le pourcentage de bases guanine et cytosine dans une séquence : (nombre de G + nombre de C) / nombre total de bases x 100. Le calculateur compte chaque type de base dans la séquence fournie et applique ce ratio.
Pourquoi la teneur en GC importe-t-elle pour la PCR et le séquençage ?+
Une teneur en GC plus élevée augmente la stabilité thermique d'un duplex d'ADN car les paires G-C forment trois liaisons hydrogène contre deux pour A-T, ce qui élève la température de fusion et peut rendre les régions riches en GC plus difficiles à dénaturer et à amplifier, nécessitant souvent des conditions de PCR ou des additifs ajustés.
Qu'est-ce qu'une teneur en GC 'normale' ?+
Cela varie énormément selon les organismes, d'environ 25% dans certains génomes riches en AT à plus de 70% dans les génomes riches en GC, donc il n'existe pas de valeur normale universelle ; ce qui compte davantage pour le travail en laboratoire, c'est de savoir si la teneur en GC d'une amorce ou d'un amplicon spécifique se situe dans une plage exploitable de 40-60% pour une PCR classique.
Comment le calculateur traite-t-il les bases ambiguës comme N ?+
Les codes IUPAC ambigus (N, R, Y, etc.) sont généralement exclus du numérateur et du dénominateur, ou traités selon la convention indiquée par l'outil, car ils ne représentent pas une base G, C, A ou T définie ; vérifiez cette convention si votre séquence contient de nombreuses bases ambiguës.
La teneur en GC seule peut-elle prédire la température de fusion ?+
Pas précisément : la teneur en GC est corrélée au Tm mais ignore les effets spécifiques à la séquence et à la longueur, donc deux séquences ayant une teneur en GC identique peuvent avoir des températures de fusion différentes ; la teneur en GC est surtout utile comme indicateur de dépistage rapide, à combiner avec un calcul dédié du Tm.